Durante il Medioevo e nei secoli successivi, la sorgente fu molto usata dalla popolazione del luogo e Quintiliano Ermacora , il notaio tolmezzino vissuto tra il '500 e il '600, primo storiografo della Carnia, ne sottolineò la popolarità per le proprietà curative in campo dermatologico. Il governo della repubbica di Venezia, subentrato nel 1420 al potere patriarcale, aveva inserito Arta nella giurisdizione della Magnifica Comunità di Tolmezzo, nell’ambito amministrativo del Quartiere di San Pietro.

Alla fine del XVIII secolo, nella parentesi del Regno Italico di  Napoleone Arta viene inclusa nel Dipartimento di Passariano, Distretto di Tolmezzo, Cantone di Paluzza. Durante questo periodo si concluse la fase empirica dell’uso delle acque pudie, che dall’inizio dell’Ottocento incominciarono ad essere studiate anche attraverso esperienze chimiche sino alla completa e documentata analisi qualitativa e quantitativa delle sue componenti. 

Con la restaurazione e l’arrivo del governo austriaco, Arta, con la provincia del Friuli, entrò a far parte del Regno Lombarto-Veneto, nel distretto di Paluzza, come comune di III classe. Nel 1819, al posto del Convocato degli Estimati, proprio dei comuni di III classe, venne concesso un consiglio comunale.

Agostino Pagani, protomedico a Udine dell’imperial-regio governo di Vienna, fu l’iniziatore di una vera e propria cura di idrologia clinica, istruì molti medici, dettando precise indicazioni e controindicazioni per le varie forme morbose. Fiorirono poi anche da parte di botanici, fisici, chimici, naturalisti, geologi, gli studi e le esperienze sulle acque sulfuree e sui vantaggi climatologici del loro ambiente presso Arta.
Vere e proprie stagioni di cura presso la fonte Pudia ebbero inizio verso la metà dell’800 e continuò anche con l’unione del Friuli occidentale al Regno d’Italia 1866. Il comune venne ufficialmente istituito il 19 novembre.